合理适量的河道采砂对河道行洪是有好处的。但滥采乱挖河道砂石主要会造成以下几个方面的危害：一是影响防洪安全。在河道内滥采乱挖砂石在一定程度上改变了河床结构和水流形势，导致局部河势恶化，河槽下切，部分河岸崩塌，危及护岸、防洪堤等水工程和桥梁等交通设施的安全；二是水质及水生态环境遭到破坏。由于河床同时也是水生生物的栖息地，大量的非法采砂会影响到水生生物的生存、繁衍，特别是在鱼类的繁殖期。此外，由于采砂设备和人员的生活污水、废油等直接排入河中，对附近水域水质造成一定的污染；三是影响河道航运。对，于通航河道，滥采乱挖河道砂石，会恶化航道水域和港口运行条件，干扰助航设施的正常运用，同时采砂船只容易挤占主航道，影响水上交通安全。
河道采砂许可实行统一办理制度。从事河道采砂活动的单位和个人应当向县级人民政府水行政主管部门提出申请，提交河道采砂申请书。县级以上水行政主管部门根据有关法律法规及河道采砂规划进行审查，决定是否发放许可证。经营性河道采砂，如果有两个以上申请人提出河道采砂申请的，应当依法通过招标方式作出许可决定。
